La Gobernación Marítima de Talcahuano al igual que la Dirección General de Territorio Marítimo cumplió su Sesquicentenario, ya que durante la presidencia de Don Manuel Bulnes, el 30 de Agosto de 1848, el Congreso dicta la Ley que organiza el "Departamento Marítimo de Valparaíso" declarando subordinados a él, a las Gobernaciones Marítimas en las que se había dividido el litoral de la república, encontrándose dentro de estas, la Gobernación Marítima de Concepción; siendo, posteriormente, subdividida el 11 de Julio de 1870 quedando esta separada en las siguientes subdelegaciones : Tome. Talcahuano (Subdelegación principal y sede de la Gobernación Marítima), Coronel, Lota y Lebu.
Esta Repartición desde sus inicios ha tenido un papel preponderante en esta área del país, debido a que aquí se marcaron hitos importantes en el desarrollo de los intereses marítimos tales como: Año 1827 la Goleta "Terrible" inicia el transporte de correspondencia y pasajeros entre Talcahuano, Valparaíso y El Callao; y el mismo año zarpa desde este puerto la Goleta "Yanqui" con pabellón Norteamericano para cambiarlo 2 años mas tarde por la bandera Chilena siendo esta nave precursora del cabotaje en Chile. En el Año 1830 el Bergantín "Globo" zarpó desde Talcahuano con el primer cargamento de salitre con destino a Europa.
Entre los Gobernadores Marítimos se destacan, Don Juan Williamas Rebolledo quien después de tomar Posesión de Estrecho de Magallanes fue nombrado para ocupar este puesto y el Capitán de Corbeta Don Estanislao Lynch (Hermano de Don Patricio Lynch) quien después de su destacada participación en la Guerra del Pacífico ocupó el cargo de Gobernador Marítimo.
Desde Principios de este siglo la dependencias de la Gobernación Marítima de Talcahuano han estado ubicadas en la antigua Avenida Costanera (hoy Avenida Blanco Encalada). El edificio original, de dos pisos, sufrió graves daños durante el maremoto de 1960 por lo que tuvo que ser demolido y en su lugar se levantó el edificio que se encuentra hoy en servicio; con diferentes readecuaciones en el transcurso de los años para poder cumplir con una adecuada atención de Público.
Entre el año 1987 y 2000 se anexa a la jurisdicción de la Gobernación Marítima, la Capitanía de Puerto de Pichilemu (que actualmente pertenece a la jurisdicción de la Gobernación Marítima de San Antonio) modificándose el límite Norte hasta la Punta Topocalma y manteniéndose el límite Sur en Cabo Tirua incluyendo las Islas Quiriquina. Santa María y Mocha, además de los lagos Lanalhue, Vichuquen y Colbún.
